بنهاية الدور الأول للتصفيات الإفريقية المؤهلة لكأس العالم 2022، والتي كشفت عن المنتخبات 14 المترشحة للدور الثاني، فإن الإتحاد الدولي لكرة القدم والكونفدرالية الإفريقية سيجريان في وقت لاحق قرعة لتشكيل المجوعات العشرة التي سيتبارى بداخلها 40 منتخبا في إطار بطولة مصغرة من 6 جولات بنظام الذهاب والإياب.
وسيتم توزيع المنتخبات 40 على أربع قبعات، كل قبعة من 10 منتخبات، بالإعتماد على التصنيف الدولي، وهو ما يعني أن الفريق الوطني الذي يصنف ضمن أفضل خمسة منتخبات إفريقية (المركز 41 عالميا)، سيتواجد في القبعة الأولى ليتجنب الوقوع مع منتخبات إفريقية قوية، مثل الجزائر، السنغال، تونس، نيجيريا، غانا وكوت ديفوار.
ويقضي نظام التصفيات، بأن يجري الدور الثاني بمشاركة 40 منتخبا، يوزعون على 10 مجموعات، ويتأهل متصدر كل مجموعة للدور الثالث، الذي سيجري على شكل مواجهات مباشرة بين العشرة منتخبات، لتتأهل 5 منتخبات لنهائيات كأس العالم 2022 بقطر.